Wenn für die „Programme“-Indizierungsregel die Option „macOS LaunchServices-Datenbank verwenden“ eingeschaltet ist (was standardmäßig der Fall ist), dann werden Programm-Aliase nicht indiziert, weil diese nicht in der LaunchServices-Datenbank verzeichnet sind. Diese Datenbank enthält nur eine Liste aller installierten Programme an ihren Original-Orten.
Wenn du diese Option hingegen ausschaltest, durchsucht LaunchBar die angegebenen Programm-Ordner auf der Festplatte und berücksichtigt dabei auch Programm-Aliase. Der Indizierungsvorgang dauert dann aber mitunter etwas länger (abhängig von der Anzahl der Dateien und Unterordner innerhalb der indizierten Programm-Ordner).